Марта логачева: Марта Логачева — биография, информация, личная жизнь, фото — supermodelsgroup.ru

Содержание

Марта Логачева, Киев, Украина

Личная информация

Деятельность

скрыта или не указана

Можно редактировать: да

Обязательно к заполнению: нет

Можно скрыть настройками приватности: да

Интересы

скрыты или не указаны

Можно редактировать: да

Обязательно к заполнению: нет

Можно скрыть настройками приватности: да

Любимая музыка

скрыта или не указана

Можно редактировать: да

Обязательно к заполнению: нет

Можно скрыть настройками приватности: да

Любимые фильмы

скрыты или не указаны

Можно редактировать:

да

Обязательно к заполнению: нет

Можно скрыть настройками приватности: да

Любимые телешоу

скрыты или не указаны

Можно редактировать: да

Обязательно к заполнению: нет

Можно скрыть настройками приватности: да

Любимые книги

скрыты или не указаны

Можно редактировать: да

Обязательно к заполнению: нет

Можно скрыть настройками приватности: да

Любимые игры

скрыты или не указаны

Можно редактировать: да

Обязательно к заполнению: нет

Можно скрыть настройками приватности:

да

Любимые цитаты

скрыты или не указаны

Можно редактировать: да

Обязательно к заполнению: нет

Можно скрыть настройками приватности: да

О себе

скрыто или не указано

Можно редактировать: да

Обязательно к заполнению: нет

Можно скрыть настройками приватности: да

Марта Логачева сериалы.

Смотреть сериалы с Марта Логачева онлайн. Марта Логачева фильмография на РОССЕРИАЛ.НЕТ HD

Дата выхода: 9 января 2017

Премьера новой 100 серийной мелодрамы «Райское место» от телеканала Украина. В основе сюжета — история 18-летней девушки Нины. Еще в раннем детстве она потеряла своих родителей и вынуждена самостоятельно прокладывать путь к счастливому будущему. У девушки есть заветная мечта — когда-нибудь стать владелицей собственной гостиницы. И к своей цели она двигается семимильными шагами: Нина учится в техникуме гостиничного хозяйства и параллельно устраи…

_{Кинотеатр}
6.6 (86)

1 004 167 HD

Дата выхода: 22 августа 2016

Премьера новой мелодрамы «Певица» не телеканале Украина.

История молодой и прекрасной девушки Наташи с провинциального городка. Она сама пишет и воплощает в реальность свою сказку. Вопреки всему, девушка преодолевает все препятствия на пути к успеху, к популярности. Станет ли девушка знаменитой оперной певицей или жизненные обстоятельства и зависть врагов помешают ей? Официальная страница сериала

_{Кинотеатр}
6.7 (61)

842 556 HD

Дата выхода: 11 января 2016

Премьера новой мелодрамы «Не зарекайся» 2016 года от телеканала Украина.

Действия сериала перенесут нас в 2014 год в Украину. Началась непризнанная война на востоке Украины. Обычная девушка, провожает своего парня в зону АТО, как ее называет власть, а в народе на войну. Так уж сложилась ее судьба, что она не знает вернется ли он или нет. Но она всегда будет его ждать и верить. Они пообещали друг другу, жить только ради своей половинки и их …

_{Кинотеатр}
7.4 (126)

_{Кинопоиск}
5. 7 (227)

2 361 711 HD

Дата выхода: 10 августа 2015

«Клан Ювелиров» — новая 95 серийная украинская мелодрама от канала ТРК Украина. Есть правила больших денег, интриг и прочего, кто же посмеет пойти наперекор всем правилам и что с этого получится, Вы увидите в новой мелодраме «Клан Ювелиров». Уже многие годы, два больших ювелирных кланов враждуют между собой. Тимур и Зоя пойдут наперекор всему. Интриги, любовь, чувства… Официальная страница сериала

_{Кинотеатр}
7.5 (57)

_{Кинопоиск}
6. 3 (168)

921 256

СЕРИАЛЫ ПО ГОДАМ:

СЕРИАЛЫ ПО ЖАНРАМ:

СЕРИАЛЫ ПО ТВ КАНАЛАМ:

Марта Логачева. Фильмы с участием Марта Логачева — Джек и Нео

Зоя

«История о девушке из очень состоятельной семьи; о таких г…»

История о девушке из очень состоятельной семьи; о таких говорят «родилась с золотой ложкой во рту». Никогда не знавшая ни в чем отказа, она однажды принимает решение отомстить человеку, которого винит в гибели её любимого парня. Став на тропу войны и мести, Зоя, сама того не ожидая, проходит путь…

Референт

«Узнав об измене мужа, Марина решает начать новую жизнь. Н…»

Узнав об измене мужа, Марина решает начать новую жизнь. Но квартира, в которой они с Андреем и их сыном Глебом провели лучшие годы, принадлежит свекрови Елене Константиновне, которая невестку терпеть не может. Да и в свои двадцать семь Марина в совершенстве освоила лишь профессию хранительницы до…

Солнечный ноябрь

«Главные герои картины брат и сестра Нина и Кирилл Петро…»

Главные герои картины брат и сестра Нина и Кирилл Петровские из благополучной обеспеченной семьи, в которой царят любовь и взаимопонимание. Молодые люди очень близки, их отношения наполнены нежностью и юмором. Кирилл лучший ученик гимназии, он хорошо рисует, популярен среди сверстников и особ…

Райское место (сериал)

«Отель «Райское место» самый роскошный горнолыжный курор…»

Отель «Райское место» самый роскошный горнолыжный курорт в Карпатах. И именно там хочет работать Нина Костюк, круглая сирота, живущая в закарпатском селе в доме своего дяди. Однако станет ли «Райское место» для девушки местом, где живет счастье?

Не зарекайся (сериал)

Кинопоиск 5.6

«Жизнь десятиклассницы Людмилы Полищук изменилась в один д…»

Жизнь десятиклассницы Людмилы Полищук изменилась в один день, 1 сентября. Утром юная девушка пошла в школу на праздник Первого звонка, а вернулась в тюрьму, обвиненная в совершении страшного убийства. Люда ничего не помнила только свои руки и одежду, почерневшие от крови известного на весь Кры…

Певица (сериал)

«Сказка, которую она напишет сама»

У Наташи Кречет особый дар она обладает прекрасным голосом. Судьба дает ей шанс стать певицей сводит ее с известным продюсером Гариком Королем. И девушка убегает от отца в столицу к матери, которая бросила девочку еще в раннем детстве. На своем пути Наташа понесет потери, встретит подлость и …

Клан Ювелиров (сериал 2015 – . ..)

Кинопоиск 6.3

«В мире больших денег, лжи и интриг опасность грозит каждо…»

В мире больших денег, лжи и интриг опасность грозит каждому, кто осмелится пойти наперекор установленным правилам игры. Однажды, в эпицентр противостояния двух враждующих ювелирных кланов попадают отчаянные влюбленные Зоя и Тимур. Вступив в схватку с самой судьбой, и не раз заглянув в лицо смерти…

Логачева Марта | Кастинги в Киеве

strict warning: Non-static method view::load() should not be called statically in /home/kievcasting/public_html/sites/all/modules/views/views.module on line 1113.
strict warning: Declaration of views_handler_field::query() should be compatible with views_handler::query($group_by = false) in /home/kievcasting/public_html/sites/all/modules/views/handlers/views_handler_field.inc on line 0.
strict warning: Declaration of content_handler_field::element_type() should be compatible with views_handler_field::element_type($none_supported = false, $default_empty = false, $inline = false) in /home/kievcasting/public_html/sites/all/modules/cck/includes/views/handlers/content_handler_field. inc on line 0.
strict warning: Declaration of views_handler_argument::options_validate() should be compatible with views_handler::options_validate($form, &$form_state) in /home/kievcasting/public_html/sites/all/modules/views/handlers/views_handler_argument.inc on line 0.
strict warning: Declaration of views_handler_argument::query() should be compatible with views_handler::query($group_by = false) in /home/kievcasting/public_html/sites/all/modules/views/handlers/views_handler_argument.inc on line 0.
strict warning: Declaration of views_handler_filter::options_validate() should be compatible with views_handler::options_validate($form, &$form_state) in /home/kievcasting/public_html/sites/all/modules/views/handlers/views_handler_filter.inc on line 0.
strict warning: Declaration of views_handler_filter::query() should be compatible with views_handler::query($group_by = false) in /home/kievcasting/public_html/sites/all/modules/views/handlers/views_handler_filter. inc on line 0.
strict warning: Declaration of views_plugin_query::options_submit() should be compatible with views_plugin::options_submit($form, &$form_state) in /home/kievcasting/public_html/sites/all/modules/views/plugins/views_plugin_query.inc on line 0.
strict warning: Declaration of views_plugin_style_default::options() should be compatible with views_object::options() in /home/kievcasting/public_html/sites/all/modules/views/plugins/views_plugin_style_default.inc on line 0.
strict warning: Declaration of views_plugin_row::options_validate() should be compatible with views_plugin::options_validate(&$form, &$form_state) in /home/kievcasting/public_html/sites/all/modules/views/plugins/views_plugin_row.inc on line 0.
strict warning: Non-static method view::load() should not be called statically in /home/kievcasting/public_html/sites/all/modules/views/views.module on line 1113.
strict warning: Non-static method view::load() should not be called statically in /home/kievcasting/public_html/sites/all/modules/views/views. module on line 1113.
strict warning: Non-static method view::load() should not be called statically in /home/kievcasting/public_html/sites/all/modules/views/views.module on line 1113.
strict warning: Non-static method view::load() should not be called statically in /home/kievcasting/public_html/sites/all/modules/views/views.module on line 1113.
strict warning: Non-static method view::load() should not be called statically in /home/kievcasting/public_html/sites/all/modules/views/views.module on line 1113.
strict warning: Non-static method view::load() should not be called statically in /home/kievcasting/public_html/sites/all/modules/views/views.module on line 1113.
strict warning: Declaration of views_plugin_access_role::options_submit() should be compatible with views_plugin_access::options_submit($form, &$form_state) in /home/kievcasting/public_html/sites/all/modules/views/plugins/views_plugin_access_role.inc on line 0.

Марта

Логачева

Размер одежды

Постоянная ссылка на страницу: http://kiev-casting. com/node/9621

Сериал Не зарекайся: фото, видео, описание серий

Многосерийная мелодрама производства кинокомпании Front Cinema.

Главные роли в 100-серийном телефильме «Не зарекайся» сыграли Виталий Салий, Валерия Ходос и Настя Блажчук. Также в сериале снялись актеры: Фёдор Гуринец, Вячеслав Довженко, Константин Данилюк, Марта Логачева, Анна Лебедева, Екатерина Варченко, Яна Соболевская, Дмитрий Суржиков, Александра Сизоненко и др.

Сюжет сериала Не зарекайся

В один день жизнь десятиклассницы Людмилы Полищук кардинально изменилась. Утром 1 сентября девушка пошла в школу на праздник Первого звонка, а вернулась… в тюрьму. Люду обвинили в совершении убийства известного на весь Крым политика Владимира Мешкова. Люда не помнила ничего — только свои руки и одежду, которые были все в крови.

Семья погибшего делает все, чтобы девочку-босячку приговорили к пожизненному заключению. Ошалевший от ярости младший брат Мешкова Александр даже пытается убить Люду, но в последний момент колеблется, обещая ей, что она никогда не выйдет на свободу. На этом несчастья бедняжки не заканчиваются — уже в тюремной больнице Люда узнает, что беременна, и понимает, что убитый политик Мешков на самом деле совершил над ней страшное надругательство, которое она уже никогда не сможет доказать. В отчаянии Люда отдает новорожденную дочь старшей сестре, пообещав себе, что сделает все, чтобы потом воссоединиться с ней.

Познав суровую жизнь на зоне, Люда все еще надеется на новую жизнь. Еще месяц — и останутся позади 17 трудных лет в женской колонии на Луганщине. Всего месяц — и Люда покинет прежнее тюремное прозябание и сможет обнять родную дочь, которую все эти годы ни разу не видела. Но наступает 2014 год, и всем планам осужденной Людмилы Полищук не дано сбыться. Ее ждет настоящий ад войны на Донбассе, измена родных людей, страшные тайны, в которые она, еще девочкой, невольно была втянута. И долгая дорога к единственному в этом мире родному человеку…

Съемочная группа сериала Не зарекайся

Режиссеры: Дмитрий Гольдман, Сергей Кравец

Сценаристы: Татьяна Гнедаш, Ярослава Сегал, Андрей Перцен, Анатолий Карлюга, Елена Терешкова, Мария Духота, Ольга Боева

Оператор: Сергей Никифоров

Композитор: Никита Янощук

Продюсеры: Татьяна Гнедаш, Саша Ткаченко

В ролях: Виталий Салий, Валерия Ходос, Настя Блажчук, Фёдор Гуринец, Вячеслав Довженко, Константин Данилюк, Марта Логачева, Анна Лебедева, Валерия Гуляева, Екатерина Варченко, Яна Соболевская, Светлана Шекера, Андрей Исаенко, Дмитрий Суржиков, Алиса Гурьева, Екатерина Вишнёвая, Светлана Зельбет, Ксения Вертинская, Александр Попов, Константин Октябрьский, Александра Сизоненко и др.

Клан ювелиров

«Клан ювелиров» (укр. Клан ювелipiв) — украинский телесериал 2015 года. Онлайн премьера состоялась 10 августа 2015 года, телевизионная — 17 августа.

Синопсис

1983 год. Отслужив в советской армии, Георгий Метревели из Кутаиси и Борис Кравец из Полтавы отправляются во Львов, чтобы обучиться ювелирному мастерству. Там они оба влюбляются в девушку Елену, которая выбирает Георгия. Это событие открывает путь противостояния, которое разгорается спустя более чем 20 лет, когда дети враждующих семей Зоя и Тимур влюбляются друг в друга.

Актёры и персонажи

Наталья Денисенко — Зоя Мовчан, внебрачная дочь Бориса Кравца, старшая дочь Марго.
Андрей Фединчик — Тимур МетревелиЧенати, старший сын Георгия и Елены, жених Зои, муж Натальи, отец Зоиной дочки
Константин Данилюк — Борис Кравец, отец Натальи и Зои.
Вячеслав Довженко — ГеоргийИраклий Метревели, отец Тимура, Габриэлы и Михаила.
Валерия Ходос — Елена Метревели, жена Георгия, мать Тимура, Габриелы, Михаила.
Светлана Зельбет — Евгения Кравец, жена Бориса, дочь Льва Марковича.
Вита Смачелюк — Марго/Марта Грациани, мать Зои и Кати, владелица ночного бара «У Марты».
Елизавета Зайцева — Наталья Кравец, дочь Евгении и Бориса.
Александр Пискунов — Михаил Метревели, сын Елены и Георгия.
Алексей Череватенко — Васо Долидзе, ближайший соратник Георгия.
Лилия Яценко — Габриэла Метревели, дочь Георгия и Елены.
Глеб Мацибора — Павлик Мовчан, сын Анатолия и Любы.
Дмитрий Суржиков — Анатолий Мовчан, приемный отец Зои..
Анна Лебедева — Люба Мовчан, жена Анатолия.
Виталий Салий — Дмитрий Красненко, полковник СБУ.
Михаил Кукуюк — Зиновий Павленко, отец Николая.
Антонина Макарчук — Галина Павленко, жена Зиновия, мать Николая, бывшая секретарша в «Галицком ювелире».
Михаил Досенко — Николай Павленко, сын Зиновия и Галины.
Дмитрий Гаврилов — Роман, охранник дома Метревели.
Владимир Нечепоренко — Лев Маркович Галицкий, отец Евгении, глава фирмы «Галицкий ювелир».
Ирина Дорошенко — Параска Кравец, мать Бориса, бабушка Зои и Михаила.
Софья Письман — Роза, домработница в доме Кравцов.
Анастасия Блажчук — Оксана, племянница Розы, домработница в доме Кравцов.
Анна Адамович — Катя Грациани, младшая дочь Маргариты.
Андрей Титов — Семён, охранник семьи Кравец.
Сергей Солодов — Илья.
Андрей Журба — Виктор, отец Кеши, сотрудник «Галицкого ювелира».
Андрей Билоус — Кирилл, юрист «Галицкого ювелира».
Мария Хомутова — Валентина, подруга Зои.
Стася Егорова — Раиса, подруга Натальи.
Дмитрий Гольдман — Серго, глава ювелирного дома Метревели, отец Георгия.
Татьяна Круликовская — Лида, домработница в доме Метревели.
Кристина Синельник — Мария.
Денис Роднянский — Нестор, друг Марго, помощник в ночном баре «У Марты».
Наталья Кленина — Ядзя, подруга Марго, помощница в ночном баре «У Марты».
Михаил Федорченко — Кеша.
Игорь Иващенко — Гудимов, врач.
Ксения Баша-Довженко — Тамара.
Игорь Рубашкин — Геннадий Шульга, молочник.
Марта Логачева — Марыся.
Константин Попудренко — Леонид Ложкин, банкир.
Сергей Стрыгин — Георгий Метревели в молодости.
Дмитрий Усов — Борис Кравец в молодости.
Денис Тарасов — Михаил Метревели в детстве.

Производство

Автором сценария стала Татьяна Гнедаш, имеющая в своём арсенале разработку сюжетов сериалов «Бессмертник», «Дворняжка Ляля», «Сашка», «Маруся». Сценарием предусмотрено 95 серий, разделённых на пять частей. Сюжет содержит в себе мотивы шекспировской «Ромео и Джульетты», вулфовской «Ювелира и герцогини», «Крёстного отца» Марио Пьюзо, «Богатые и знаменитые» Алехандро Ромайя.

Фильм был создан продакшн компанией Front Cinema, входящей в состав холдинга Медиа Группа Украина.

Съёмки начались в мае 2015 года, продлятся полгода, и будут проходить в режиме нон-стоп. Съемки ведутся в Киеве (район Воздвиженка) и Киевской области (село Горбовичи)., Львов же в картине будет представлен видами улиц и панорамой.

Релиз

10 августа 2015 года в 18.00 состоялся допремьерный онлайн показ сериала на канале телеканала «Украина» в YouTube. В телеэфир сериал вышел 17 августа в 18:00.

Рейтинги

Телесериал по данным Индустриального телевизионного комитета за период с 17 по 23 августа в среднем получил рейтинг 2,97% и долю 13% по аудитории «18+, вся Украина», и рейтинг 3,52% с долей 14,29% по коммерческой аудитории канала «18+, 50 тыс+». При этом сам телеканал «Украина» за этот период получил меньшие показатели: рейтинг 1,63% и долю 10,99% по «18+, вся Украина», и рейтинг 1,75% с долей 11,6% по «18+, 50 тыс. +».

Среди сериальных продуктов проект две недели занимал шестую позицию.

Оценки

По мнению украинского журналиста и писателя Андрея Кокотюхи, «Клан ювелиров» представляет собой актуальный украинский сериал. Под этим он подразумевает новые приёмы в продвижении, оригинальный сюжет (не заимствованный из российских аналогов), учёт украинской топонимики и активное использование украинского языка наряду с русским.

Lucia Specia

Прошлая деятельность

Я был сопредседателем демонстрации с Майклом Полом и Мэттом Постом на EMNLP 2017 в Копенгагене.
Я прочитал приглашенную лекцию на марафоне машинного перевода в Лиссабоне в августе 2017 года.
Я выступил с программной речью на конференции «Текст, речь и диалог» в Праге, август 2017 года.
Я был сопредседателем программы с Роджером Леви из CONLL 2017, который будет совмещен с ACL 2017 в Ванкувере.
Я совместно с Даниэлем Сер, Мона Диаб, Энеко Агирре и Иниго Лопес-Гаспио организовал совместную задачу по семантическому текстовому сходству в рамках SemEval-2017, которая проводилась совместно с ACL 2017 в Ванкувере.
Я был сопредседателем обучающего семинара с Александром Клементьевым из EACL 2017 в Валенсии, апрель 2017 года.
С 2015 по 2018 год я был секретарем Европейской ассоциации машинного перевода (EAMT).
Я совместно с Десмондом Эллиоттом, Стеллой Франк, Лоиком Барро и Фети Бугаресом организовал второе издание совместной задачи по мультимодальному машинному переводу в рамках WMT17 в Копенгагене, сентябрь 2017 г.
Я совместно с Варварой Логачевой организовал шестое издание совместного задания по оценке качества в рамках WMT17 в Копенгагене, сентябрь 2017 г.
Я выступил с программной речью на конференции TeTra в Форли, сентябрь 2016 г.
Я был сопредседателем с Крисом Дайером и Грэмом Нойбигом по машинному переводу в ACL 2016 в Берлине, август 2015 года.
Я совместно с Десмондом Эллиоттом, Стеллой Франк и Халилом Симааном (Амстердамский университет) организовал новую совместную задачу по мультимодальному машинному переводу в рамках WMT16 в Берлине, август 2016 года.
Я совместно с Каролиной Скартон и Варварой Логачевой (Университет Шеффилда) организовал пятое издание совместного задания по оценке качества в рамках WMT16 в Берлине, август 2016 г.
Я совместно с несколькими коллегами организовал семинар и разделил задание по оценке качества для упрощения текста, которое состоится с LREC 2016 в Портороже, Словения, в мае 2016 года.
Я совместно с Густаво Паецольдом (Университет Шеффилда) организовал новое совместное задание по Комплексная идентификация слов в рамках SEMEVAL-2016, которая будет проводиться с NAACL-HLT в Сан-Диего, июнь 2016 г.
Я совместно с несколькими коллегами из проекта EU Cracker организовал семинар по Оценка перевода — от фрагментированных инструментов и наборов данных до интегрированной экосистемы, которая состоится с LREC 2016 в Портороже, Словения, в мае 2016 года.
Я был сопредседателем кафедры машинного перевода и многоязычия в EMNLP 2015 в Лиссабоне, сентябрь 2015 г.
Я совместно с Кристианом Хокампом (DCU) и Каролиной Скартон (Шеффилд) организовал четвертое издание совместной задачи оценки качества в рамках WMT15 в Лиссабоне, сентябрь 2015 г.
Вместе с Андре Мартинсом (Priberam) я провел учебное пособие по машинному обучению, функциям и метрикам для НЛП на летней школе iV & L Net в Лёвене, июнь 2015 г.
Я совместно с Мишелем Симардом (NRC) и Шэрон О’Брайен (DCU) организовал 3-й семинар AMTA 2014 года по технологии и практике постредактирования (WPT 2014). Ванкувер, октябрь 2014 г.
Я был сопредседателем учебного курса с Ксавье Каррерасом (UPC) на EMNLP 2014 в Дохе, октябрь 2014 года.
Я организовал совместно с Кристианом Баком (Эдинбург) и Раду Сорикутом (Google) третье издание общей задачи оценки качества в рамках WMT14 в Мэриленде, июнь 2014 г.
Я редактировал с Лаурой Винтер Баллинг, Майклом Карлом, Шэрон О’Брайен и Мишелем Симардом том Cambridge SP Постредактирование машинного перевода: процессы и приложения . Вы можете получить его на Amazon.
Я совместно со Стейси Бейли (MITER), Ким Харрис (Text & Form) и Китом Миллером (MITER) организовал семинар по автоматическим и ручным метрикам для оценки оперативного перевода в Рейкьявике, май 2014 г.
Я выступил с программной речью по теме «Оценка и оценка качества машинного перевода » на 35-й конференции по переводам и компьютерам в Лондоне, ноябрь 2013 г.
Я был основным докладчиком на семинаре Errare Workshop on Errors by Humans and Machines in Multimedia, Multimodal and Multilingual Data Processing в Эрменонвиле, Франция, ноябрь 2013 года, где я говорил о прогнозировании качества машинного перевода и прогнозировании ошибок .
Я прочитал приглашенную лекцию по оценке качества машинного перевода на восьмом марафоне машинного перевода (MTM 2013) в Праге, сентябрь 2013 г.
Я совместно со Стивеном Доэрти (DCU) и Дэвидом Виларом (DFKI) организовал семинар MT Summit XIV по машинному переводу и оценке, ориентированному на пользователя.Ницца, сентябрь 2013 г.
Я совместно с Мишелем Симардом (NRC) и Шэрон О’Брайен (DCU) организовал 2-й семинар MT Summit XIV по технологии и практике постредактирования (WPT 2013). Ницца, сентябрь 2013 г.
Я совместно с Раду Сорикутом редактировал специальный выпуск журнала «Машинный перевод», посвященный оценке качества . Выпуск
Я совместно с Кристианом Баком (Эдинбург) и Раду Сорикутом (Google) организовал второе издание общей задачи оценки качества в рамках WMT2013.София, август 2013 г.
Я совместно с Декаи Ву (HKUST) и Марин Карпуат (NRC) организовал седьмой семинар NAACL / HLT-2013 по синтаксису, семантике и структуре в статистическом переводе (SSST-7). Атланта, 13 июня 2013 г.
Я присутствовал на Всемирной конференции по локализации в Лондоне, где с моими коллегами по QTLaunch Pad я организовал круглый стол / учебное пособие по открытой модели оценки и оценки качества перевода, 12 июня 2013 г.
Я посетил Форум лидеров отрасли TAUS 2013 в Дублине, где я выступал с докладом об оценке качества машинного перевода, 10-11 июня 2013 года.
Я выступил с приглашенным докладом и учебным пособием по SMT / постредактированию / оценке качества на I Conferência Internacional de Tradução e Tecnologia, в Faculdade de Letras do Porto, Португалия, 13-14 мая 2013 г.
Я входил в состав консультативного совета проекта «Служба переводов Болоньи», где проводились встречи в Генте в марте 2012 г. и марте 2013 г.
Я посетил конференцию GALA в Майами, где Стивен Доэрти (DCU), Арле Ломмель (DFKI) и я организовали семинар по многомерным показателям качества в рамках проекта QTLaunchPad, 19 марта 2013 г.
Я присутствовал на саммите TAUS по оценке качества перевода в Дублине, где я председательствовал на секционном заседании по улучшению показателей автоматической оценки машинного перевода, 14-15 марта 2013 года.
Арль Ломмель и я провели веб-семинар GALA по многомерным показателям качества QTLaunchPad 21 февраля 2013 года. Вы можете найти запись здесь.
Я был приглашенным докладчиком на коллоквиуме проекта VARTRA «Вариация перевода » в Саарбрюккене, январь 2013 г.
Я читал учебник по статистическому машинному переводу на семинаре Vision and Language Network Workshop (VL’12) в Шеффилде, декабрь 2012 г.
Я совместно с Мишелем Симардом и Шэрон О’Брайен организовал семинар AMTA-2012 по технологии и практике постредактирования (WPT 2012). Сан-Диего, октябрь 2012 г.
Я выступил с приглашенным докладом на Седьмом марафоне машинного перевода (MTM 2012) в Эдинбурге, сентябрь 2012 г.
Я был приглашенным докладчиком на семинаре по экспертным знаниям в области перевода и постредактированию, исследованиям и применению в Копенгагене, август 2012 г. Слайды
Я совместно с Декаи Ву и Марин Карпуат организовал шестой семинар ACL-2012 по синтаксису, семантике и структуре в статистическом переводе (SSST-6).Чеджу — Корея, июль 2012 г.
Я совместно с Раду Сорикутом организовал совместное задание по оценке качества на WMT-2012. Монреаль, июнь 2012 г.
Я совместно с Радой Михалча и Суджай Джаухар организовал совместное задание по лексическому упрощению английского языка на SemEval-2012. Монреаль, июнь 2012 г.
Я был сопредседателем программы EAMT-2012, 16-й ежегодной конференции Европейской ассоциации машинного перевода с Энди Уэй. Тренто, май 2012 г.
Я помогал в организации семинара LREC «Обработка естественного языка для улучшения доступности текста» (NLP4ITA) с Рикардо Баеза-Йейтс, Палома Мореда, Лус Релло и Орасио Саггион.Стамбул, май 2012 года.
Я был спикером на конференции GALA в Монте-Карло, март 2012 года.
Я посетил семинар по семантическому текстовому сходству, финансируемый DARPA, в Нью-Йорке, март 2012 года.
Я входил в состав консультативного совета проекта Bologna Translation Service в Генте, февраль 2012 г.
Вхожу в редколлегию журнала «МТ» с декабря 2011 года.
Я был приглашенным докладчиком на Международном семинаре по использованию лингвистической информации для гибридного машинного перевода — LIHMT в Барселоне, ноябрь 2011 г.
Я был приглашенным докладчиком на семинаре «Знакомство с MT для пользователей: исследования и переводчики» в Люксембурге, октябрь 2011 г.
Я был программным председателем симпозиума по информационным и гуманитарным технологиям STIL-2011. Куяба — Бразилия, октябрь 2011 г.
Я читал учебник по статистическому машинному переводу на РАНЛП-2011, Хисар, Болгария, сентябрь 2011 г.
Я читал приглашенную лекцию в Имперском колледже.
Я был одним из руководителей специальной темы «Семантика в SMT» на Пятом семинаре ACL-2011 по синтаксису, семантике и структуре в статистическом переводе.
Я получил награду BEST PAPER на конференции EAMT в Лёвене 30-31 мая 2011 года.
Я выступал с докладом на тему «Оценка качества машинного перевода» в CGNL / DCU в июле 2011 года.
Я присутствовал на встрече DARPA GALE, проходившей в Вашингтоне 10-11 мая. Я также выступил с докладом в IBM Watson во время визита.
Я был одним из редакторов специального выпуска журнала «Машинный перевод: расширение границ статистического машинного перевода».
Я принял участие в панели SemEval-2010, чтобы обсудить смысловую оценку и будущее семинара.
Я представил систему для кросс-языковой лексической замены на SemEval-2010, и она заняла 2-е место из 15 систем.
Моя докторская диссертация была награждена Лучшей докторской диссертацией на конкурсе, организованном Propor Conference, проведенном в Бразилии в апреле 2010 года, за докторские диссертации по НЛП, защищенные за последние 3 года в Бразилии или Португалии.
Я провел учебник по статистическому машинному переводу в компании Propor в Бразилии, апрель 2010 г.Материал находится в разделе «Ресурсы

Я потерял счет до 2010 года. И, наверное, многое забыл после 2010 года …

ТРЦ проспект: Новости

режим работы
SEC 10:00 — 22:00

НОВОСТИ

Как сделать красивые фото еды: интервью с олей

11-04-2019

23 марта в ТРЦ «Проспект» прошел мастер-класс «Как сделать красивые фото еды: лайфхаки и советы фуд-фотографа Анны Логачевой. «Weekend записали лайфхаки от Логачевой и спросили участников мастер-класса об их впечатлениях.

Читать больше

Как сделать красивые фото еды: интервью с Еленой

11-04-2019

23 марта в ТРЦ «Проспект» прошел мастер-класс «Как сделать красивые фото еды: лайфхаки и советы фуд-фотографа Анны Логачевой.«Weekend записали лайфхаки от Логачевой и спросили участников мастер-класса об их впечатлениях.

Читать больше

Как сделать красивые фото еды: интервью с Мариной

11-04-2019

Читать больше

Как сделать красивые фото еды: интервью с Сашей

11-04-2019

23 марта в ТРЦ «Проспект» прошел мастер-класс «Как сделать красивые фото еды: лайфхаки и советы фуд-фотографа Анны Логачевой.«Weekend записали лайфхаки от Логачевой и спросили участников мастер-класса об их впечатлениях.

Читать больше

Как сделать красивые фото еды: интервью с Ириной

11-04-2019

Читать больше

Как сделать красивые фото еды: интервью с Людмилой

10-04-2019

23 марта в ТРЦ «Проспект» прошел мастер-класс «Как сделать красивые фото еды: лайфхаки и советы фуд-фотографа Анны Логачевой.«Weekend записали лайфхаки от Логачевой и спросили участников мастер-класса об их впечатлениях.

Читать больше

Как сделать красивые фото еды: интервью с Алиной

11-04-2019

Читать больше

Как сделать красивые фото еды: интервью с Оксаной

11-04-2019

23 марта в ТРЦ «Проспект» прошел мастер-класс «Как сделать красивые фото еды: лайфхаки и советы фуд-фотографа Анны Логачевой.«Weekend записали лайфхаки от Логачевой и спросили участников мастер-класса об их впечатлениях.

Читать больше

Как сделать красивые фото еды: лайфхаки и советы

10-04-2019

Мастер-класс от фуд-фотографа Анны Логачевой в ТРК «Проспект»

Читать больше

Узнай первым о распродажах и новинках! Подпишитесь на рассылку новостей!

Скрытые случаи дупликации и ремолдинга гена тРНК в митохондриальных геномах амфипод

Основные моменты

•: 7 дупликаций гена тРНК и 10 случаев повторной сборки были обнаружены в геномах mt амфипод.
•: Большинство случаев ремолдинга выявлено в mt геномах байкальских амфипод.
•: Модели, специфичные для амфипод, подходят для правильной аннотации генов тРНК mt.

Abstract

Эволюция генов тРНК в митохондриальных (mt) геномах — это сложный процесс, который включает дупликации, дегенерации и транспозиции, а также специфический процесс изменения идентичности посредством мутаций в антикодоне (изменение гена тРНК или рекрутирование гена тРНК).Используя модели тРНК, специфичные для амфипод, для аннотации, мы показываем, что дупликации тРНК более обычны в геномах mt амфипод, чем то, что было выявлено в предыдущих аннотациях. В mt геномах амфипод обнаружено семнадцать случаев дупликаций генов тРНК, и десять из них были генами тРНК, подвергшимися ремолдингу. Дополнительные данные о генах тРНК были подтверждены с помощью филогенетического анализа и анализа генетических расстояний. Большинство реформированных генов тРНК (семь из десяти случаев) были обнаружены в геномах mt эндемичных видов амфипод из озера Байкал. Все дополнительные гены тРНК мт возникли независимо у байкальских амфипод, что указывает на необычную пластичность эволюции генов тРНК в этих видовых сообществах. Обсуждаются возможные причины необычного обилия дополнительных генов тРНК в mt-геномах байкальских амфипод.

Модели тРНК, специфичные для амфипод, разработанные для MiTFi, уточняют существующие прогнозы генов тРНК у амфипод и выявляют дополнительные случаи дупликации генов тРНК, которые не учитываются при использовании менее специфичных моделей для всех Metazoa.Применение этих моделей для предсказания гена тРНК mt будет полезно для правильной аннотации геномов mt амфипод и, возможно, других ракообразных.

Ключевые слова

Митохондриальный геном

Ремолдинг гена тРНК

Амфиподы

Байкал

Anticodon

Рекомендуемые статьиЦитирующие статьи (0)

Полный текст

Цитирующие статьи

Самые просматриваемые статьи по микробиологии в марте 2016 г.

— Новости науки и исследований

Недавно изолированные Paenibacillus tyrfis sp.nov., из почвы тропических торфяных болот Малайзии с широким спектром антимикробной активности
Юн-Кит Ав, Куан-Шион Онг, Жжан-Хан Ли, Юн-Лин Чеу, Кэтрин М. Юл и Суй-Мэй Ли ^*

Биогеохимические и микробные вариации на 5500 км поверхности Антарктических отложений указывают на то, что органическое вещество является движущей силой структуры бентосного сообщества , Скотт Р.Сантос, Эндрю Р. Махон и Кеннет М. Халанич

GenSeed-HMM: инструмент для прогрессивной сборки с использованием профильных HMM в качестве семян и его применение в Alpavirinae Вирусное открытие на основе метагеномных данных
Жоао М.П. Алвес, Андре Л. де Оливейра, Татьяна О.М. Сандберг, Хайме Л. Морено-Гальего , Марсело А.Ф. де Толедо, Элизабет М.М. де Моура, Лилиан С. Оливейра, Алан М. Дарем, Долорес У. Менерт, Паоло М. де А. Занотто, Алехандро Рейес ^* и Артур Грубер ^*

Расширение диеты для диеты: доноры электронов, поддерживающие прямой межвидовой перенос электронов (DIET) в определенных сокультурах
Li-Ying Wang, Kelly P. Невин, Тревор Л. Вудард, Бо-Чжонг Му и Дерек Р. Ловли ^*

Метагеномический подход к оценке влияния диетических добавок с Ascophyllum nodosum или Laminaria digitata на функцию рубца в ферментерах Rusitec
Алехандро Беланче ^*, Элеонора Джонс, Чарльз Дж. Ньюбольд 9080, Чарльз Дж.

Антропогенное осаждение азота замедляет распад, способствуя бактериальному метаболизму: выводы из метагеномного анализа
Захари Б.Фридман ^*, Рима А. Апчерч, Дональд Р. Зак и Лорен К. Клайн

Сообщества микробов в ландшафте полярной пустыни высокой Арктики
Клэр М. Макканн, Мэтью Дж. Уэйд, Нил Д. Грей, Дженнифер А. Робертс, Кейси Р. Дж. Хуберт и Дэвид В. Грэм

Lactobacillus reuteri Ингибирование энтеропатогенных Escherichia coli Прилипание к эпителию кишечника человека
Алистер Д. С. Уолшем, Дональд А.Маккензи, Вивьен Кук, Саймон Уэмисс-Холден, Клэр Л. Хьюс, Натали Джуг и Стефани Шуллер ^*

Метагеномный анализ бактериальных сообществ снежной поверхности Антарктики
Анна Лопатина, Софья Медведева, Сергей Шмаков, Мария Д. Логачева, Вячеслав Крыленков и Константин Северинов ^*

Позвоночные хозяева как острова: динамика отбора, иммиграции, потери, устойчивости и потенциальной функции бактерий на коже саламандры
Эндрю Х.Лаудон ^*, Арвинд Венкатараман, Уильям ВанТреурен, Дуглас К. Вудхэмс, Лаура Вегенер Парфри, Валери Дж. Маккензи, Роб Найт, Томас М. Шмидт и Рид Харрис

Наталья Петровна Логачева | Semantic Scholar

Сезонная динамика первичной продукции в пелагиали южной части озера Байкал

Резюме Мы измерили первичную продукцию фитопланктона в южном бассейне озера Байкал, Россия, путем инкубации 13C-бикарбоната in situ в период с марта по октябрь в США. два года подряд… Развернуть

Сохранить

Предупреждение

Ссылка

Research Feed

Исследования некоторых механизмов лекарственной устойчивости при хроническом миелоидном лейкозе (CML).

ХМЛ — это миелопролиферативное заболевание, связанное со специфической транслокацией хромосом (9; 22) и появлением слитного гена / белка BCR-ABL. Считается, что белок BCR-ABL ингибирует апоптоз… Развернуть

Сохранить

Предупреждение

Цитировать

Research Feed

Фотосинтетический потенциал фитопланктона в глубоководной части озера Байкал, Россия

Мы изучили фотосинтетическую активность сообщества собран с поверхности на глубину до 1000 м в южной котловине Байкала.Эксперименты проводились в июне (смешивание… Развернуть

Сохранить

Предупреждение

Цитировать

Research Feed

Отчетливое влияние различных мутантов p53 на дифференцировку и жизнеспособность лейкозных клеток человека K562.

Мутации супрессора опухоли p53 часто встречаются наблюдаются при различных опухолях человека, включая бластный кризис хронического миелогенного лейкоза (ХМЛ). Характер мутаций р53 при ХМЛ показывает некоторые… Развернуть

Сохранить

Предупреждение

Ссылка

Research Feed

Роль распределения размеров фитопланктона в озере экосистемы, выявленные путем сравнения структуры сообщества планктона между озером Байкал и озером Бива

Влияние распределения фитопланктона по размерам на изменения структур планктонных пищевых сетей с эвтрофикацией было изучено с использованием естественных планктонных сообществ в двух всемирно известных… Развернуть

Сохранить

Оповещение

Cite

Rese arch Feed

[Влияние опухолевого супрессора р53 и его мутантных форм на дифференцировку и жизнеспособность лейкозных клеток K562].

Мутации опухолевого супрессора p53 часто наблюдаются при различных злокачественных новообразованиях человека, включая бластный криз хронического миелогенного лейкоза (ХМЛ). Паттерн мутации p53 в CML показывает некоторые… Развернуть

Сохранить

Предупреждение

Цитировать

Research Feed

[Адаптация цепной реакции полимеразы обратной транскриптазы для клинической диагностики экспрессии гена MDR1].

Химиотерапия злокачественных опухолей обычно неэффективна из-за устойчивости к ней опухолевых клеток.Известны два типа устойчивости: устойчивость клеток к определенному лекарству и множественная лекарственная устойчивость… Развернуть

Сохранить

Предупреждение

Цитировать

Research Feed

[Функциональная активность и экспрессия P-гликопротеина при хроническом миелоидном лейкозе].

AIM Оценить прогностическую значимость Р-гликопротеина (Pgp) при хроническом миелоидном лейкозе (ХМЛ). МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ Функциональная активность (тест родамин 123) и экспрессия Pgp (связывание… Развернуть

Сохранить

Предупреждение

Ссылка

Research Feed

[Характеристики лекарственной устойчивости опухолевых плазматических клеток in vitro у пациентов с множественной миеломой, которые по-разному реагируют на химиотерапию] .

AIM Определить чувствительность опухолевых плазматических клеток in vitro к цитостатическим препаратам (преднизолон, алкеран белустин, винкристин, рубомицин, доксорубицин, цитарабин, метотрексат, цисплатин, этопозид). … Развернуть

Сохранить

Alert

Cite

Research Feed

Новые внутриядерные симбиотические бактерии из макронуклеуса Paramecium putrinum — Candidatus Gortzia yakutica

Abstract

Внутриклеточные бактерии Alpha -protepora из Paramecium инфузорий и других протистов. Alphaproteobacteria привлекли значительное внимание как ближайшие существующие родственники бактерий, давших начало митохондриям, а также как класс внутриклеточных бактерий с многочисленными важными патогенами. Клада

HLB включает два рода — Holospora (Hafkine 1980) и Candidatus Gortzia (Boscaro 2013). Эти бактерии имеют особый жизненный цикл с двумя морфологическими формами, строгую специфичность к виду хозяина и типу ядра, в котором они обитают.

Здесь мы описываем новый вид HLB — Candidatus Gortzia yakutica sp. nov., симбионт из макронуклеуса Paramecium putrinum , первого известного HLB для этого вида Paramecium . Новый симбионт имеет морфологическое сходство с другими HLB. Филогенетический анализ гена рДНК SSU помещает его в кладу Candidatus Gortzia clade.

Введение

Paramecium инфузории ( Oligohymenophorea , Ciliophora , Alveolata ) являются хозяевами различных внутриклеточных симбионтов (S.Фокин и Горц 2009; Preer, Preer и Jurand 1974; Gortz 2006; Gong et al. 2014), среди которых наиболее изученными являются Holospora , облигатно внутриядерные бактерии порядка Holosporales , класс Alphaproteobacteria. Девять видов Holospora к настоящему времени были морфологически охарактеризованы и названы; однако гены 16S рРНК были секвенированы только для четырех из них ( H. obtusa, H. undulata, H. acuminata, и H. curviuscula ). Holospora имеют сложный жизненный цикл, включающий две морфологические стадии, инфекционную и репродуктивную. Инфекционные формы (ИФ) обычно имеют большие размеры (до 20 мкм в длину), имеют гипертрофированную периплазму, занимающую примерно половину клетки, и кончик узнавания на конце периплазмы. Они могут выжить в условиях окружающей среды в течение нескольких часов и инфицировать новые клетки-хозяева. Репродуктивные формы (RF) имеют небольшие размеры и способны воспроизводиться путем двойного деления и могут трансформироваться в IF. Эти признаки используются для отнесения бактерий к группе Holospora -подобных бактерий (HLB), даже если полная последовательность гена 16S рРНК недоступна.

Виды Holospora делятся на две группы в соответствии с поведением инфекционных форм при делении инфицированного ядра. Только инфекционные формы H. obtusa , H. undulata , H. elegans , H. curviuscula и H. acuminata собираются около центра веретенообразного аппарата делящегося ядра хозяина, образующего так — так называемый соединительный элемент, при этом репродуктивные формы в основном появляются в апикальных частях ядра.После образования соединительного элемента IFs проникают в цитоплазму, а затем в окружающую среду. Вторая группа из видов Holospora ( H. caryophila, H. bacillata, и H. curvata ) не образует соединительного звена (Garrity 2000). Boscaro et al. недавно сообщили о новом роде HLB, Candidatus Gortzia, который, очевидно, является сестринским таксоном роду Holospora (Boscaro et al. 2013). В настоящее время род включает два вида: Сandidatus, Gortzia influenctiva (Boscaro et al.2013) и Сandidatus G. shahrazadis (Серра и др., 2016), макроядерные симбионты P. jenningsi и P. multimicronucleatum, соответственно. Последовательности их гена 16S рРНК отличаются на 9,1–9,7% от 16S рРНК видов Holospora . Эти симбионты не вызывают образования соединительного звена в ядре при делении Paramecium .

Здесь мы сообщаем о новой Holospora -подобной внутриядерной бактерии в макронуклеусе инфузории Paramecium putrinum , происходящей из Якутии (Республика Саха), Россия.Наши микроскопические наблюдения, филогенетический анализ на основе генов 16S рРНК и флуоресцентные тесты гибридизации in situ позволяют предположить его включение в качестве нового представителя рода Gortzia . Предлагаем отнести эту бактерию к новому виду Сandidatus Gortzia yakutica sp. п.

Материалы и методы

Отбор проб и идентификация Paramecium

Инфузория Paramecium putrinum была первоначально выделена из пресноводного пруда в Якутии (62 ° 02′N 129 ° 44′E), Республика Саха, Россия, летом 1955 г. 2013.Моноклональные культуры этого вида поддерживали в стандартных условиях, как описано в Sonneborn, при комнатной температуре в среде салата, инокулированной бактерией Enterobacter aerogenes в качестве пищевого ресурса (Sonneborn, 1970). Хозяина идентифицировали по морфологии клетки, строению микроядра и сократительной вакуоли (Wichterman 1986; Fokin 2010). Живые наблюдения и изображения были выполнены в Научном парке Центра культивирования коллекции микроорганизмов СПбГУ на микроскопе Leica DM2500 с функцией дифференциального интерференционного контраста (ДИК).

Сингены различных клонов P. putrinum определяли серией скрещиваний с тест-клонами P. putrinum из двух сингенов (репродуктивно изолированные группы). Все культуры кормили накануне эксперимента. Примерно 100 клеток тестируемых клонов смешивали с равным количеством клеток тестовых клонов. Распределение сингенов тестируемых клонов хорошо согласуется с двумя кладами, идентифицированными с помощью филогенетического анализа гена цитохромоксидазы I (Tarcz et al.2014).

Фенотипическая характеристика симбионтов

Инфекционная способность симбионтов была доказана путем добавления ПФ бактерий к неинфицированной культуре P. putrinum . Эксперименты по перекрестному заражению проводили с различными клонами P. putrinum из обоих сингенов. Клетки Paramecium , содержащие ПФ симбионта, концентрировали при 4500 г в течение 10 мин и гомогенизировали с использованием 1% раствора детергента Nonidet P-40 (Sigma-Aldrich Cat No.21-3277 SAJ). Небольшое количество гомогената проверяли при 200-кратном увеличении, чтобы убедиться, что все клетки инфузорий разрушены. Равные количества гомогената смешивали с реципиентными культурами Paramecium и инкубировали при комнатной температуре. Клетки наблюдали через 24 и 48 ч после заражения. Дополнительные проверки смешанных культур проводили четыре раза в течение следующих двух месяцев.

Очистка и секвенирование симбионтов

Культура клеток P.putrinum , содержащий IF симбионта, концентрировали и гомогенизировали, как указано выше. Инфекционные формы эндосимбионта выделяли из гомогената центрифугированием в градиенте плотности Перколла (Sigma-Aldrich Cat No. P1644), как описано ранее (Rautian and Wackerow-Kouzova 2013). ДНК из очищенных IFs была выделена с использованием набора DNeasy Blood and Tissue (QIAGEN Cat No. 69504) с использованием модифицированного протокола, как описано ранее (Garushyants et al. 2018).

Бактериальные универсальные праймеры 27F1 (5’-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3 ’) и 1492R (5’-GGTTACCTTGTTACGACTT-3’) использовали для амплификации 16S рДНК.Продукты ПЦР очищали в геле и клонировали с помощью набора для очистки TIAN Quick Midi Purification Kit (Tiangen, Пекин, Китай) в соответствии с рекомендациями производителя. Очищенную рДНК вставляли в плазмидный вектор PTZ57 R / T (InsTAclone PCR Clone Kit, Fermentas, Канада), рекомбинантные плазмиды трансформировали в компетентные клетки Trans5α (TransGen Biotech, BeiJing, Китай). Положительные клоны переваривали Hha I (Fermentas, Thermo Scientific). Клоны, уникальные для которых был определен анализ RFLP, секвенировали с помощью автоматического секвенатора ДНК ABI (модель 373, PE Applied Biosystems).

Флуоресценция in situ гибридизация (FISH)

Флуоресцентная гибридизация in situ (FISH) с зондами, нацеленными на рРНК, была проведена для визуализации локализации симбионта. Зонд был разработан специально для нового HLB — Gyak567 (5’-AGGTAGCCACCTACACA-3 ’). Последовательность была помечена флуоресцентным красителем цианин 5 (Cy5) на 5 ’конце. Мы также использовали зонд ALF1b для Alphaproteobacteria , меченный цианином 3 (Cy3), в качестве положительного контроля. П.Культуру клеток putrinum , содержащую симбионтов, концентрировали центрифугированием при 3000 g в течение 10 мин. Клетки фиксировали в 4% параформальдегиде в буфере 1X PBS при 4 ° C в течение 3 часов, встряхивая каждые 30 минут. Клетки осаждали центрифугированием и дважды промывали раствором PBS для удаления остаточного фиксатора. Добавляли буфер для гибридизации (0,9 M NaCl, 20 мМ Tris-HCI pH 7,2, 0,01% SDS) и зонды до конечной концентрации 5 нг / мкл. За гибридизацией следовали три 20-минутных промывания после гибридизации при 48 ° C в промывочном буфере (0. 9 M NaCl, 20 мМ Tris-HCl pH 7,2, 0,01% SDS). Все эксперименты включали отрицательный контроль без зондов для проверки автофлуоресценции. Слайды наблюдались с помощью конфокального лазерного сканирующего микроскопа Leica TCS SP5 в The Chromas Core Facility Санкт-Петербургского государственного университета.

Филогенетический анализ

Последовательности генов 16S рРНК были получены из GenBank (Benson et al.2012) для 33 Rickettsiales , Holosporales и других родственных бактерий (см. Рис.5 для инвентарных номеров). Использовали только последовательности длиннее 1200 п.н. и короче 1500 п.н. Первоначальное множественное выравнивание было построено с использованием mafft v7.407 (REF) с настройками по умолчанию, а затем отфильтровано с использованием BMGE v1.12 (Criscuolo and Gribaldo 2010) на основе расхождения последовательностей и процента пробелов, что привело к сокращению с 2040 до 1300 позиций. Полученное выравнивание было дополнительно урезано, чтобы учесть самые короткие последовательности; с этой целью 102 п. н. с 5’-конца и 87 п.н. с 3’-конца были обрезаны, в результате чего получилось окончательное множественное выравнивание в 1111 п.н.RAxML v8.2.12 (Stamatakis 2014) был запущен на этом согласовании. Корневое филогенетическое дерево было создано с использованием модели GTRGAMMA с 1000 бутстрапов. Полученное корневое филогенетическое дерево было визуализировано с помощью Interactive Tree of Life v4 (Letunic and Bork 2019). Последовательность 16S рДНК нового HLB, штамма YA111-52, была депонирована в базе данных GenBank под номером доступа MK209687.1. Сходство последовательностей оценивали путем реципрокного выравнивания мегабластов полных нуклеотидных последовательностей рДНК GenBank 16S и визуализировали с помощью ggplot2 и R.

Результаты

Морфология и локализация бактерий

Симбиотические бактерии населяют макронуклеусы P. putrinum (рис. 1 A). Инфекция была стабильной в нескольких клонах P. putrinum в течение не менее трех лет в лабораторных условиях. Что нехарактерно для HLB, небольшое количество инфекционных форм может быть обнаружено в цитоплазме клетки-хозяина (рис. 2), что позволяет предположить, что существует промежуточное состояние перед высвобождением симбионта в окружающую среду.Симбионты наблюдались в двух морфологических формах жизненного цикла: (1) мелкие (1-2 × 2-4 мкм) бактерии, подвергающиеся постоянным бинарным делениям (репродуктивные формы, RF), и (2) длинные (1-2 × 7 мкм). -12 мкм) инфекционные формы (ИФ). Большинство наблюдаемых ПЧ имели прямую стержнеобразную форму с заостренными концами, а некоторые были слегка изогнутыми (рис. 1B). Симбионты никогда не наблюдались в микроядре ни в стабильно инфицированных культурах, ни в процессе инфицирования.

Рисунок 1.
(A) P. putrinum с бактериями в макронуклеусе; МА — макронуклеус, МИ — микронуклеус; (B) Инфекционные формы нового HLB, высвобождаемые из макронуклеуса.
Рисунок 2.
P. putrinum с бактериями в макронуклеусе и отдельными инфекционными формами в цитоплазме (показано черными стрелками). МА — макронуклеус, МИ — микронуклеус.
Мы никогда не наблюдали образования соединительного элемента во время деления клетки-хозяина (рис. 3), как у ранее описанных видов из рода Candidatus Gortzia. Эта особенность, а также ядерная и хозяйская специфичность также приближают этот новый симбионт к « H. bacillata », « H.curvata »и H. sp. из макронуклеуса P. putrinum (Фокин, Горц, 2009).
Рис. 3.
P. putrinum в процессе деления. Соединительный элемент не наблюдается.
Симбионты способны инфицировать апосимбиотические клетки P. putrinum . ПФ достигают макронуклеуса и начинают делиться через 20-30 часов после заражения, образуя цепочки клеток, характерные для HLB. Апосимбиотические клетки двух клонов P. putrinum , принадлежащих к разным сингенам, были экспериментально инфицированы ПФ нового симбионта.Заражение обоих клонов оставалось стабильным не менее двух месяцев.
Молекулярная характеристика
Последовательность 16S рДНК длиной 1393 п. н. была получена из нового HLB и депонирована в GenBank под номером доступа MK209687.1. Используя технику FISH с зондом Gyak567, мы обнаружили большое количество бактерий в макронуклеарах P. putrinum (рис. 4B). Зонд, специфичный для последовательности Gyak567, связывался с бактериями внутри макронуклеуса в наших экспериментах FISH, тем самым демонстрируя, что охарактеризованная последовательность гена 16S рРНК происходит от HLB.Зонд ALF1b использовали в качестве положительного контроля (фиг. 4A).
Фигура 4.
Клетки P. putrinum с симбионтами в макронуклеарах, меченные зондами ALF1b (A) и Gyak567 (B). Одиночный ПФ, лежащий вне макронуклеуса, показан белой стрелкой.
Филогенетический анализ
Филогенетический анализ уверенно помещает новый HLB в ветвь Gortzia как родственный таксон двум другим видам Gortzia , Candidatus G.Infectiva и Candidatus G. shahrazadis, макронуклеарные симбионты P. jenningsi и P. multimicronucleatum . Однако уровень дивергенции последовательностей 3% и 3,5% нового HLB с Candidatus, G. shahrazadis и Candidatus, G. influenctiva, соответственно, предполагает, что новый HLB является отдельным видом в кладе HLB и роду Candidatus. Горция. Два ранее описанных вида Candidatus Gortzia имеют 1.08% расхождения в опубликованных ими последовательностях 16S рДНК. Отличие нового HLB от видов рода Holospora колеблется от 9% до 11% (рис. 6). Поскольку HLB являются облигатными симбионтами и не подлежат культивированию вне клеток-хозяев, полная характеристика, зависящая от культуры, не может быть предоставлена; поэтому мы предлагаем временное название « Candidatus Gortzia yakutica».
Рис. 5.
Филогенетическое дерево максимального правдоподобия порядка Holosporales . Значения поддержки Bootstrap показаны на каждой ветке.
Рисунок 6.
Дивергенция Holospora -подобных бактерий на основе гена 16S рДНК. Идентичность нуклеотидных бластов полных последовательностей 16S используется в качестве меры сходства последовательностей.
Филогенетическое дерево демонстрирует убедительную монофилию всех HLB, включая роды Holospora и Candidatus Gortzia (рис. 5). Сестринская группа HLB включает и других симбионтов, например. г. род Caedibacter.
Обсуждение
Здесь мы сообщаем о новой Holospora -подобной бактерии из макронуклеуса P.Падринский . Все особенности этой бактерии, такие как морфология, внутриклеточная локализация, сложный жизненный цикл, специфичность к хозяину и ядру, а также инфекционность, указывают на тесную связь этого симбионта с другими Holospora--подобными бактериями. Не исключено, что этот вид ранее был описан Фокиным (С. Фокин, Горц, 2009) как « Holospora sp. из макронуклеуса P. putrinum », но эта культура была утеряна, что не позволяет дать подробную характеристику.
Филогенетический анализ на основе последовательности гена 16S рРНК также показывает, что симбионт близок к другому Holospora . Недавно описанные макроядерные симбионты из P. multimicronucleatum , Candidatus, G. Infctiva и Candidatus G. shahrazadis являются ближайшими родственниками нового симбионта и вместе они образуют сестринскую кладу с другими видами Holospora . Подобно Candidatus G. influenctiva и Candidatus G. shahrazadis, новый симбионт не вызывает образования соединительного звена во время деления хозяина. Следовательно, мы относим эту симбиотическую бактерию к роду Gortzia и называем ее Candidatus Gortzia yakutica sp.ноя
Несмотря на то, что наше исследование поддерживает кладу Gortzia , вопрос создания нового рода заслуживает обсуждения. Клада HLB явно монофилетична, и все HLB, по-видимому, очень похожи по своим морфологическим и физиологическим характеристикам. Анализ последовательностей гена 16S рРНК широко используется для принятия решений о бактериальной таксономии, несмотря на очевидные ограничения, вызванные частой множественностью генов 16S рРНК в геноме, что в некоторых случаях приводит к существенной вариации последовательностей 16S рРНК в одном геноме, поскольку а также различный уровень сходства внутри вида, рода или семейства. Приблизительный порог 97% сходства 16S рРНК, как сообщалось ранее, для определения вида бактерий (Větrovský and Baldrian 2013). Для многих фенотипически охарактеризованных HLB полный ген 16S еще не секвенирован. Недавно было продемонстрировано, что полные последовательности генома могут быть использованы для четкого определения видов бактерий, что эффективно разрешает давние теоретические дебаты (Jain et al. 2018; Moldovan and Gelfand 2018). Таким образом, мы можем заключить, что мы были бы в гораздо лучшем положении, чтобы сделать вывод о филогенетических отношениях клады Gortzia , когда полные геномы Gortzia spp.становятся доступными.
Описание Gortzia yakutica sp. nov
Gortzia yakutica (Gor’tzi.a ya.ku’ti.ca; NL fem. n. Gortzia, в честь заслуженного профессора Ханса-Дитера Гёрца; NL fem. adj. yakutica , из или принадлежащих Республике Якутии — название региона, в котором впервые была собрана бактерия).
Облигатные макронуклеарные эндосимбионты свободноживущей инфузории P. putrinum , изредка встречаются в цитоплазме. Пробы взяты из пресноводного пруда в Республике Якутия, Россия.Имеет две стадии жизни: мелкие репродуктивные формы (1-2 на 2-4 мкм) и длинные инфекционные формы (1-2 на 7-12 мкм, палочковидные с заостренными концами, иногда слегка изогнутые). Образования соединительной детали не наблюдалось. Основание для определения: последовательность гена рРНК SSU (номер доступа в GenBank: MK209687.1) и положительное совпадение с видоспецифическим олигонуклеотидным зондом FISH Gyak567 (5’-AGGTAGCCACCTACACACA-3 ’). Невозможно культивировать вне клеток-хозяев.
Активный хроматин и транскрипция играют ключевую роль в разделении хромосомы на топологически ассоциированные домены
Сергей В.Ульянов1,2,12,
Храмеева Екатерина Евгеньевна3,4,12,
org/Person»> Гаврилов Алексей Александрович1,
Илья Михайлович Флямер1,2,
Павел Кос5,
Михалева Елена Александровна6,
Пенин Алексей Александрович 4,7,8,
Мария Д.Логачева4,8,9,
Имакаев Максим Викторович10,
org/Person»> Александр Чертович5,
Михаил Сергеевич Гельфанд4,11,
Юрий Юрьевич Шевелев6 и
Разин Сергей Владимирович1,2

¹ Институт биологии гена РАН, 119334 Москва, Россия;

² Кафедра молекулярной биологии, Московский государственный университет им. М. В. Ломоносова, 119991 Москва, Россия;

³ Сколковский институт науки и технологий, 143026 Сколково, Россия;

⁴ Институт проблем передачи информации (Институт Харкевича) РАН, 127051 Москва, Россия;

⁵ Физический факультет МГУ им. М.В. Ломоносова, 119991 Москва, Россия;

⁶ Отдел молекулярной генетики клетки Института молекулярной генетики РАН, 123182 Москва, Россия;

⁷ Кафедра генетики биологического факультета МГУ им. М.В. Ломоносова, 119991 Москва, Россия;

⁸ А.Институт физико-химической биологии им. Н.А. Белозерского МГУ им. М.В. Ломоносова, 119234 Москва, Россия;

⁹ Российский национальный исследовательский медицинский университет им. Н.И. Пирогова, 117997 Москва, Россия;

¹⁰ Физический факультет Массачусетского технологического института, Кембридж, Массачусетс 02139, США;

¹¹ Факультет биоинженерии и биоинформатики МГУ им. М.В. Ломоносова, 119234 Москва, Россия
Автор, ответственный за переписку: sergey.v.razin {at} usa.net
№12 Эти авторы внесли равный вклад в данную работу.
Аннотация
Последние достижения, сделанные с помощью техники Hi-C, раскрыли многие принципы складывания хромосом, которые впоследствии были связаны с заболеванием и генной регуляцией. В частности, Hi-C показал, что хромосомы животных организованы в топологически ассоциативные домены (TAD), эволюционно консервативные компактные домены хроматина, которые влияют на экспрессию генов.Механизмы, которые лежащие в основе разделения генома на TAD остаются малоизученными. Чтобы изучить принципы сворачивания TAD в Drosophila melanogaster , мы выполнили Hi-C и poly (A) ⁺ RNA-seq в четырех клеточных линиях различного происхождения (S2, Kc167, DmBG3-c2 и OSC). В отличие от предыдущих исследований, мы обнаружили, что области между TAD (т.е. между TAD и границами TAD) у Drosophila только слабо обогащены инсуляторным белком dCTCF, в то время как другой инсуляторный белок Su (Hw) предпочтительно присутствует внутри TAD.Однако Drosophila inter-TAD несут активный хроматин и конститутивно транскрибируемые (домашние) гены. Соответственно, мы находим, что привязка инсуляторных белков dCTCF и Su (Hw) гораздо хуже предсказывают границы ТАД, чем метки активного хроматина. Интересно, что inter-TAD соответствуют декомпактным межполосным полосам политенных хромосом, тогда как TAD в основном соответствуют плотно упакованным полосам. Коллективно наши результаты предполагают, что TAD представляют собой конденсированные домены хроматина, обедненные активными метками хроматина, разделенные областями активный хроматин.